後來，玉泉山溫泉全國元世祖忽必烈和明英朱祁鎮都正在玉泉山建制過規模分歧的。那時這裏仍然是“山下泉流似玉虹，清涼不分衆泉同”。

公元1190年，金代的一章完顔景，前後三次幸玉泉山，對“泉味甘洌”的玉泉水很是喜愛，曾正在這裏建“泉水院”認爲避暑之地，並以“玉泉垂虹”引爲“燕京八景”之一，我們從“垂虹”兩字可想見，昔時這裏水流是十分充沛的。

河工們放水挖泥，當挖到第七層時，猛然見到塔壁上刻著一行字，第一泉--玉泉山乾隆近前一看，登時嚇出了一身盜汗，本來塔壁上刻著“玉泉山下一泉眼，塔露原身全國反”。乾隆看罷，情急智生，忙叫人正在泉邊立碑，親筆寫下“全國第一泉”五個字，趕忙放水將浮圖覆沒正在水中。後來他又撰寫了《禦制玉泉山下第一泉記》勒石立于泉邊。

據傳乾隆還曾特制“銀鬥”來權衡全國名泉水的沈輕，其是：玉泉山鬥沈一兩，濟南趵突泉水鬥沈一兩二厘，揚子金山泉水鬥沈一兩三厘，北京玉泉山溫泉江浙的惠山、虎跑二泉之水鬥沈一兩四厘，玉泉山泉水爲全國最輕，清朝的宮廷中飲用的水都取之于玉泉，每天由插著龍旗的水車，經西曲門運入宮中。每天西曲門一打開城門，第一個進城的就是運水車，每輛車上放著四個桶，蓋著繡龍的大苫布，招搖過市，曾爲舊一景。曹溪溫泉

爲此，乾隆將“玉泉垂虹”改爲“玉泉趵突”。聽說這時還發生了一件驚動朝野的傳言，說是玉泉山的水泉中有座鎮海浮圖，礁溪民宿塔身正在泉水中，水面僅漏一個塔尖，並且這座浮圖跟著水勢變化而變化，水位高，塔身也跟著升高，水落下去，塔身也跟著降下去。乾隆傳聞當前，想看個大白，就傳旨挖泉。

到了清朝，康熙也看上了玉泉山一帶的清山碧水，從康熙十九年（1680年）到三十一年（1692年）前後用了12年時間修制了斑斓弘大的靜明圓。因爲大規模的改建擴建，對玉泉山的地形地貌有所粉碎，因此到清乾隆年間到挂似垂虹的玉泉流水，曾經變得“噴薄如珠”了。